1.損耗大：貨物的進入庫基本是人工記憶作業，造成貨物存放位置數量不準；因錯誤作業或錯誤配送所引起的嚴重后果。

2.效率低：傳統的平面倉庫是“人工一紙質一貨架”與自動化倉庫中的“計算機數據貨架”的作業模式相比，工作效率低且失誤多，且增加工作量。

3.資源浪費：倉儲面積/實用率往往得不到利用而造成大量空間資源的閑置浪費；傳統作業方式致使設備的能力不能充分發揮而造成浪費。

4.成本高：傳統的倉庫信息化程度較低、整體倉儲物流管理水平低下，需要大量人工作業；因信息流和物流無法統一致使總體倉儲成本提高。

5.不可控：入庫數量不準，產品質量無法保障可觀的周轉周期；串貨、丟貨、產品流向不能精準控制。